Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms