Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pm20d2A3KG59 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pm20d2A3KG59 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms