Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4985A2ALC6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Gm4985A2ALC6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm4985A2ALC6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm4985A2ALC6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm4985A2ALC6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm4985A2ALC6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm4985A2ALC6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm4985A2ALC6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm4985A2ALC6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4985A2ALC6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms