Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms