Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap5A2AGT5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms