Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms