Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms