Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms