Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Scn2aA0A0J9YTW6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn2aA0A0J9YTW6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn2aA0A0J9YTW6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn2aA0A0J9YTW6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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