Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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