Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp3Q9QY23 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Pkp3Q9QY23 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp3Q9QY23 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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