Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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