Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ddx20Q9JJY4 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddx20Q9JJY4 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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