Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ndst3Q9EQH7 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ndst3Q9EQH7 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms