Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2□□□□□ -2.09
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Ccdc39Q9D5Y1 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc39Q9D5Y1 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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