Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hddc3Q9D114 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hddc3Q9D114 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms