Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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