Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Clstn3Q99JH7 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Clstn3Q99JH7 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms