Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ddb2Q99J79 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ddb2Q99J79 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ddb2Q99J79 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ddb2Q99J79 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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Ddb2Q99J79 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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Ddb2Q99J79 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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