Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp38Q8BW70 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms