Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms