Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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Sft2d1Q5SSN7 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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Sft2d1Q5SSN7 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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Sft2d1Q5SSN7 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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Sft2d1Q5SSN7 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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