Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trim71Q1PSW8 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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