Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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ptchd1Q14B62 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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ptchd1Q14B62 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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ptchd1Q14B62 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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ptchd1Q14B62 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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ptchd1Q14B62 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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