Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ttc39dQ0VF76 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms