Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Ttc21bQ0HA38 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms