Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Sh3bp2Q06649 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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Sh3bp2Q06649 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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Sh3bp2Q06649 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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Sh3bp2Q06649 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp2Q06649 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms