Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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