Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Rpl28P41105 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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