Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
PtprmP28828 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PtprmP28828 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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