Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RxraP28700 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RxraP28700 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RxraP28700 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RxraP28700 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RxraP28700 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RxraP28700 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RxraP28700 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RxraP28700 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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