Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PrkcaP20444 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms