Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
P10404 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
P10404 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
P10404 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
P10404 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
P10404 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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