Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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