Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm2056J3QQ02 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm2056J3QQ02 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms