Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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Zfp558E9Q1J0 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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Zfp558E9Q1J0 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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Zfp558E9Q1J0 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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Zfp558E9Q1J0 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Zfp558E9Q1J0 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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Zfp558E9Q1J0 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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Zfp558E9Q1J0 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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Zfp558E9Q1J0 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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