Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Grik3B1AS29 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238 ms