Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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