Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cln8Q9QUK3 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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