Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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