Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RabggtaQ9JHK4 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RabggtaQ9JHK4 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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