Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms