Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc47Q9D024 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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