Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sgo1Q9CXH7 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms