Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms