Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ddb2Q99J79 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ddb2Q99J79 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms