Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Apobec3Q99J72 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec3Q99J72 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms