Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Atg4cQ811C2 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Atg4cQ811C2 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Atg4cQ811C2 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.5 ms