Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NipblQ6KCD5 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms