Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Krt40Q6IFX3 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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